DeeCamp2022总冠军：“ProteinMiner团队”AI大数据驱动的蛋白质组学

发布时间：2022-09-01 14:47:37 【来源：网易科技报道】

　　【网易科技9月1日报道】DeeCamp2022人工智能训练营总冠军答辩暨结营典礼在创新工场北京总部线上举行。经过一上午的精彩答辩，挑战大规模蛋白质组学信息发现赛题的ProteinMiner团队摘得DeeCamp2022总冠军的荣誉，另外五支队伍获得优胜奖。

　　记者获悉，DeeCamp人工智能训练营是创新工场发起的一项面向全球大学生的公益项目，专注培养应用型AI人才，迄今已经举办六届。DeeCamp2022的主题是“用AI探索生命科学新边界”，由创新工场和清华大学智能产业研究院（AIR）联合主办，来自全球各个地区顶尖高校的计算机、生命科学等专业的150位学员自发组成30支队伍，经过两个月的课程学习和项目实践，最终共六支队伍入围最终答辩环节。

　　创新工场董事长兼CEO李开复、清华⼤学智能产业研究院（AIR）院长张亚勤、沙特阿卜杜拉国王科技大学终身正教授兼中国人民大学高瓴人工智能学院访问讲座教授高欣、深圳湾实验室系统与物理生物学所资深研究员周耀旗、清华大学智能产业研究院副院长刘洋、清华大学智能产业研究院（AIR）首席研究员聂再清、中国人民大学数学科学研究员龚新奇、创新工场执行董事兼前沿科技基金总经理任博冰担任评委并出席了结营典礼。

　　创新工场董事长兼CEO、HICOOL商学院荣誉院长李开复博士表示，AI＋科学交叉是创新工场预测未来5到10年间会引爆的创新增长新范式，AI＋生命科学更是造福人类、影响深远的黄金赛道。这也是6年来一贯倡导“学以致用”的DeeCamp首次聚焦AI＋生命科学这一命题的深意所在。这次入围总决赛的6支团队都是由AI和生命科学相关专业的优秀同学组成，在顶尖科研、产业导师指导下，在蛋白质结构预测、全基因组表达预测等各种场景进行探索，挑战了多个真实世界的难题。很高兴决赛同学在这次大赛中脱颖而出，期待在不久的将来，成为中国“AI＋生命科学”赛道的创新先锋。我期许有志创业的DeeCamp同学，也可以把这次的项目实践视为产业价值的初步探索，同时关注帮助高科技创业者的北京HICOOL创业大赛及HICOOL商学院的丰富资源。

　　DeeCamp2022联合主办方、清华大学智能产业研究院（AIR）院长张亚勤院士表示：“生命科学与生物医药领域正在步入数字化3.0时代，以人工智能和数据驱动的第四科学研究范式，将辅助人类探索并解决生命健康的问题，加速生命健康与生物医药领域向着更快速、更精准、更安全、更普惠的方向稳步发展。这既是AI for Science的重大机遇，同时也将造福全人类。我很高兴做为本次DeeCamp导师和评委，过去两个多月，我看到同学们在“AI+生命科学”的大命题下，积极探索AI与生命科学的交叉发展之路，也都取得了不错的成果。最后，再次祝贺冠军团队，也希望同学们都学有所成，满载而归！”

　　在整个上午的精彩答辩后，创新工场董事长兼CEO李开复博士对六支入围队伍表示了肯定：“本次大赛中，同学们都有令人惊艳的表现，特别是在短短的一个月时间就围绕创新的课题获得出色的成果。创新工场非常关注生物计算的发展，已经围绕‘AI＋遗传中心法则’方面孵化了多家公司，包括AI+基因编辑、AI+蛋白、AI+RNA等。本届DeeCamp同学们的表现让创新工场对这些前沿领域的创新突破充满了期待，期待新世代AI+生命科学的人才投入，为未来生物计算带来更多惊喜。”

　　清华⼤学智能产业研究院（AIR）院长张亚勤院士表示，很高兴继续和创新工场联合主办本届DeeCamp。生命科学领域步入数字化3.0时代，DeeCamp2022聚焦AI+生命科学，不仅代表了当下整个科学界的研究趋势，也代表了中国的科技和产业发展趋势。AI与数据赋能的全新的科学范式，不仅会提高科学研究的效率，也将会造福整个人类社会。

　　随后，张亚勤院士公布了DeeCamp2022总冠军荣誉的归属。挑战大规模蛋白质组学信息发现赛题的ProteinMiner团队，成为本届DeeCamp的年度冠军团队。

　　DeeCamp2022冠军团队介绍：

　　蛋白质是生命活动的真正承担者。获取蛋白质的序列和结构信息，对于疾病的研究、药物的研发尤为重要。质谱作为一种生物表征仪器，在蛋白质测序领域有着支配性的地位。但面对大规模的未知序列蛋白，现有的质谱从头测序技术仍面临精度低的问题，而这是推动新抗原发现驱动的个性化免疫疗法亟待解决的难题。

　　ProteinMiner立足于AI与大数据驱动的蛋白质的质谱测序技术，致力于提升大规模地发现未知的蛋白序列与结构信息的能力。ProteinMiner首次提出预训练的AI谱图语言大模型，提升质谱从头测序的精度，加速免疫相关的新抗原/抗体的发现，以推动个性化免疫治疗的进程。此外，ProteinMiner提出谱图分类深度模型，实现快速的交联质谱数据的鉴定，构建实验数据支撑的组学规模的蛋白质空间距离信息数据库。

　　ProteinMiner团队的组建来源于大家多次合作的信任，队长毛鹏志是中科院计算所计算蛋白质组学/信息检索方向的博士生，队员还包括香港中文大学(深圳)计算机视觉硕博生叶崇杰、中科院计算所生物信息学博士生齐晓宁、香港中文大学(深圳)数据科学与大数据技术专业本科生薛浩楠。

　　夺冠后，队长毛鹏志表示，很感谢DeeCamp2022提供的资源和平台，让自己能够找到志同道合的成员们，把自己的想法落地为实践，有机会取得学术和应用场景的突破。“一切才刚刚开始。这次夺冠是我们取得的小的里程碑，我们会继续坚持做下去，希望能够做出对学术界有影响，帮助产业界降本增效，带来实际的效益的产品。这条路还有很远，非常感谢和珍惜DeeCamp为我们提供了启动资金。”

　　毛鹏志与团队成员叶崇杰都是第二次参加DeeCamp，去年他们也曾在一个团队并肩奋斗，虽然铩羽而归但反而激发再次参赛的斗志。叶崇杰说，“第二次参加DeeCamp，是出于对DeeCamp和组委会的信任，也是由于对伙伴的信赖。我和鹏志有共同的愿景，我也相信他的能力和责任心，能够带领我们取得成功。”

　　值得一提的是，队伍里的薛浩楠同学，刚刚升入本科三年级的学习。被问到参与科研高手云集的DeeCamp2022的感受时，他表示，自己非常珍惜DeeCamp提供的机会，不仅能够深度体验技术落地与功能实现，还能够一窥生物信息这个当下最前沿的技术领域。这些都是自己在课堂上难以一线接触到业界前沿技术＋产业实践的机会，未来自己也有志继续在工程领域继续探索和成长。

　　另外五支入围总决赛的队伍获得了优胜奖。

上一篇：优必选将在9月与日本美邸成立合资公司，探索智慧养老方案
下一篇：最后一页