DNAnexus筹集了1亿美元用于扩展其基因组数据分析平台

发布时间:2020-06-10 15:19:03 【来源:

DNAnexus为DNA序列数据提供数据分析和管理平台,今天宣布已获得Perceptive Advisors和Northpond Ventures共同领导的一轮融资,金额为1亿美元。DNAnexus表示,这些资金将促进其国际增长,使该公司能够随着其基于云的临床测试产品的增长而服务于全球的医疗保健和生命科学组织。

许多DNAnexus客户(包括十大临床诊断公司中的八家,十大制药公司中的七家以及100多家企业)都在该平台上使用了机器学习应用程序。它们执行AI辅助变体调用,这需要识别单个核苷酸(DNA的构建基块)的取代以及来自下一代测序数据的小插入和缺失。他们依靠深度学习进行病理处理,病历解释,并从大规模数据蛋白质组学(蛋白质研究)和代谢组学(代谢产物研究)数据中提取见解。

DNAnexus由斯坦福大学教授Serafim Batzoglou和Arend Sidow以及斯坦福大学计算机科学家Andreas Sundquist于2009年成立。这三人旨在通过一套基于云的服务来解决DNA序列分析中对计算基础架构的需求,并在早期取得了成功。2013年10月,DNAnexus与贝勒医学院人类基因组测序中心合作,进行了当时最大的基于云的基因组分析,将3,751个完整基因组处理为10,771个外显子组(已知编码蛋白质的基因组区域)。 430 TB的数据。

DNAnexus客户使用公司云提供商Amazon Web Services(AWS)的计算资源来对序列数据进行分析并存储该数据。使用DNAnexus的Apollo产品,客户可以使用一系列模型上载和集成用于探索的数据集,包括临床,研究和现实世界的数据集。他们能够拖放图表以创建自定义的仪表板,以提供每个队列的快照,并通过工具,图表和可视化来探索临床数据关联,而这些工具,图表和可视化对数十亿个数据点都有意义。

DNAnexus的Titan是对Apollo的补充,它是一种平台即服务产品,旨在扩展到数千台机器和数百万个对象。通过让客户创建,优化,验证和执行管道并自动跟踪数据出处,并允许团队成员与合作者共享数据,工具和分析,同时控制访问和安全性,它使数据标准化。

产品轮中的最后一个主题-门户-为组织提供了一个展示项目的空间,其中包含数据集,他们发布的工具以及新闻和重点内容。公司可以使用门户网站向用户和合作伙伴提供包含可配置小部件的自定义登录页面,并选择和托管用户可以即时访问的具有特定版本的应用程序和工作流。门户可以根据需要将支持请求路由到客户代理,从而提供强大的帮助文档库,并且可以提供请求和批准表单,以允许用户访问,浏览和检查数据。

DNAnexus声称迄今为止已经处理了14 PB的数据,并存储了28 PB的数据,其客户现在每月运行超过100,000个计算作业,在AWS中总计超过1000万小时的核心处理时间。该公司为UK BioBank(从500,000名志愿者中收集的临床记录数据集)和国家生物技术信息中心的Sequence Read Archive提供了搜索和分析工具。它还继续与Google Brain的成员合作,以改进DeepVariant,这是Google Brain和Verily开发的一种基因组变异调用者,它利用AI模型在基因组中发现遗传变异。

DNAnexus与Microsoft合作,为St. Jude Cloud提供支持,提供对世界上最大的儿科癌症基因组数据公共存储库的访问,以加快挖掘,分析和可视化功能。泰坦(Titan)支持脊椎动物基因组计划(Vertebrate Genomes Project),该计划希望生成所有66,000种脊椎动物的参考质量基因组组装体。DNAnexus建立了PrecisionFDA,这是一个由美国食品和药物管理局支持的开放源代码平台,用于社区共享基因组信息。

DNAnexus最新一轮融资的投资者包括GV(前Google Ventures),Foresite Capital,TPG Capital,First Round Capital和首次股权投资者Regeneron Pharmaceuticals。在2019年2月的F轮融资6800万美元之后,G轮融资使该公司的总融资额超过2.7亿美元。

DNAnexus的总部位于加利福尼亚山景城,并在旧金山,伦敦和布拉格设有办事处。

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